MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017167	ATC	2	6	145721	145726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133928
3002	NC_017167	ATT	2	6	145770	145775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133928
3003	NC_017167	AG	3	6	145822	145827	50 %	0 %	50 %	0 %	384133928
3004	NC_017167	GTT	2	6	145897	145902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133928
3005	NC_017167	TCA	2	6	146007	146012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133928
3006	NC_017167	GAA	2	6	146030	146035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133928
3007	NC_017167	AT	3	6	146047	146052	50 %	50 %	0 %	0 %	384133928
3008	NC_017167	CAA	2	6	146106	146111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133928
3009	NC_017167	AAC	2	6	146166	146171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133928
3010	NC_017167	GCGG	2	8	146252	146259	0 %	0 %	75 %	25 %	384133928
3011	NC_017167	CG	3	6	146266	146271	0 %	0 %	50 %	50 %	384133928
3012	NC_017167	TTG	2	6	146289	146294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133928
3013	NC_017167	GA	3	6	146509	146514	50 %	0 %	50 %	0 %	384133928
3014	NC_017167	GATG	2	8	146530	146537	25 %	25 %	50 %	0 %	384133928
3015	NC_017167	CCA	2	6	146668	146673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133928
3016	NC_017167	GCG	2	6	146699	146704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133928
3017	NC_017167	GAA	2	6	146711	146716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133928
3018	NC_017167	AGAC	2	8	146910	146917	50 %	0 %	25 %	25 %	384133928
3019	NC_017167	GTG	2	6	146932	146937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133928
3020	NC_017167	ATG	2	6	146951	146956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133928
3021	NC_017167	GGA	2	6	146971	146976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133928
3022	NC_017167	ACC	2	6	146991	146996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133928
3023	NC_017167	TCA	2	6	147085	147090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133928
3024	NC_017167	CAG	2	6	147131	147136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133928
3025	NC_017167	GGA	2	6	147175	147180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133928
3026	NC_017167	AAG	2	6	147189	147194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133928
3027	NC_017167	GAA	2	6	147221	147226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133928
3028	NC_017167	AG	3	6	147229	147234	50 %	0 %	50 %	0 %	384133928
3029	NC_017167	AGA	2	6	147377	147382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133929
3030	NC_017167	TTG	2	6	147424	147429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133929
3031	NC_017167	GCG	2	6	147444	147449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133929
3032	NC_017167	CA	3	6	147450	147455	50 %	0 %	0 %	50 %	384133929
3033	NC_017167	CA	3	6	147503	147508	50 %	0 %	0 %	50 %	384133929
3034	NC_017167	TCGAG	2	10	147509	147518	20 %	20 %	40 %	20 %	384133929
3035	NC_017167	GA	3	6	147536	147541	50 %	0 %	50 %	0 %	384133929
3036	NC_017167	GAC	2	6	147654	147659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3037	NC_017167	CAAG	2	8	147690	147697	50 %	0 %	25 %	25 %	384133929
3038	NC_017167	AGA	2	6	147731	147736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133929
3039	NC_017167	CAAGG	2	10	147771	147780	40 %	0 %	40 %	20 %	384133929
3040	NC_017167	ATG	2	6	147819	147824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133929
3041	NC_017167	CGC	2	6	147878	147883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133929
3042	NC_017167	AGA	2	6	147896	147901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133929
3043	NC_017167	GTC	2	6	147942	147947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3044	NC_017167	CGA	2	6	147962	147967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3045	NC_017167	A	6	6	147984	147989	100 %	0 %	0 %	0 %	384133929
3046	NC_017167	TCGC	2	8	148009	148016	0 %	25 %	25 %	50 %	384133929
3047	NC_017167	GCC	2	6	148159	148164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133929
3048	NC_017167	TGAG	2	8	148219	148226	25 %	25 %	50 %	0 %	384133929
3049	NC_017167	ATG	2	6	148392	148397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133929
3050	NC_017167	TTG	2	6	148506	148511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133929
3051	NC_017167	AAC	2	6	148555	148560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133929
3052	NC_017167	CGT	2	6	148572	148577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3053	NC_017167	ATCG	2	8	148650	148657	25 %	25 %	25 %	25 %	384133929
3054	NC_017167	TTC	2	6	148666	148671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133929
3055	NC_017167	CGA	2	6	148724	148729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3056	NC_017167	GCT	2	6	148742	148747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3057	NC_017167	ACG	2	6	148881	148886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3058	NC_017167	TTC	2	6	148918	148923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133929
3059	NC_017167	GGT	2	6	148985	148990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133929
3060	NC_017167	GGTG	2	8	149104	149111	0 %	25 %	75 %	0 %	384133929
3061	NC_017167	GGT	2	6	149126	149131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133929
3062	NC_017167	GTC	2	6	149163	149168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133929
3063	NC_017167	TGG	2	6	149347	149352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133930
3064	NC_017167	GGGT	2	8	149371	149378	0 %	25 %	75 %	0 %	384133930
3065	NC_017167	GAA	2	6	149379	149384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133930
3066	NC_017167	GC	3	6	149392	149397	0 %	0 %	50 %	50 %	384133930
3067	NC_017167	TCA	2	6	149464	149469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133930
3068	NC_017167	CGT	2	6	149627	149632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133930
3069	NC_017167	CCA	2	6	149640	149645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133930
3070	NC_017167	GGT	2	6	149676	149681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133930
3071	NC_017167	TTC	2	6	149734	149739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133930
3072	NC_017167	TCA	2	6	149800	149805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133930
3073	NC_017167	TTCGA	2	10	150400	150409	20 %	40 %	20 %	20 %	384133931
3074	NC_017167	GTC	2	6	150457	150462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3075	NC_017167	TGA	2	6	150491	150496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133931
3076	NC_017167	GAT	2	6	150560	150565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133931
3077	NC_017167	GCA	2	6	150617	150622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3078	NC_017167	ACC	2	6	150663	150668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133931
3079	NC_017167	GAA	2	6	150681	150686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931
3080	NC_017167	GCA	2	6	150692	150697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3081	NC_017167	ATGCA	2	10	150790	150799	40 %	20 %	20 %	20 %	384133931
3082	NC_017167	GAA	2	6	150807	150812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931
3083	NC_017167	CT	3	6	150893	150898	0 %	50 %	0 %	50 %	384133931
3084	NC_017167	CT	3	6	150928	150933	0 %	50 %	0 %	50 %	384133931
3085	NC_017167	CGA	2	6	150934	150939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133931
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3088	NC_017167	TCA	2	6	151214	151219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133931
3089	NC_017167	AT	3	6	151273	151278	50 %	50 %	0 %	0 %	384133931
3090	NC_017167	A	6	6	151289	151294	100 %	0 %	0 %	0 %	384133931
3091	NC_017167	CGT	2	6	151334	151339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133931
3092	NC_017167	AGTC	2	8	151354	151361	25 %	25 %	25 %	25 %	384133931
3093	NC_017167	GAA	2	6	151374	151379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133931
3094	NC_017167	GGA	2	6	151394	151399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133931
3095	NC_017167	GGT	2	6	151418	151423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133931
3096	NC_017167	ATC	2	6	152846	152851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133932
3097	NC_017167	GAGG	2	8	152920	152927	25 %	0 %	75 %	0 %	384133932
3098	NC_017167	ACA	2	6	153058	153063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133933
3099	NC_017167	CGGA	2	8	153098	153105	25 %	0 %	50 %	25 %	384133933
3100	NC_017167	CGC	2	6	153127	153132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133933
3101	NC_017167	GAG	2	6	153133	153138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133933
3102	NC_017167	GCG	2	6	153258	153263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133933
3103	NC_017167	TTG	2	6	153273	153278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133933
3104	NC_017167	CAA	2	6	153593	153598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133934
3105	NC_017167	CGC	2	6	153608	153613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3106	NC_017167	TTC	2	6	153762	153767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3107	NC_017167	GTT	2	6	153806	153811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133934
3108	NC_017167	CTG	2	6	153911	153916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133934
3109	NC_017167	TTC	2	6	154005	154010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3110	NC_017167	CTT	2	6	154013	154018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3111	NC_017167	CTT	2	6	154054	154059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133934
3112	NC_017167	CCG	3	9	154060	154068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3113	NC_017167	CCG	2	6	154121	154126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3114	NC_017167	ATCC	2	8	154183	154190	25 %	25 %	0 %	50 %	384133934
3115	NC_017167	CCG	2	6	154223	154228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3116	NC_017167	CTG	2	6	154290	154295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133934
3117	NC_017167	CTGCG	2	10	154322	154331	0 %	20 %	40 %	40 %	384133934
3118	NC_017167	CCG	2	6	154438	154443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133934
3119	NC_017167	CAC	2	6	154448	154453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133934
3120	NC_017167	TCA	2	6	154549	154554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133934
3121	NC_017167	GC	4	8	154612	154619	0 %	0 %	50 %	50 %	384133934
3122	NC_017167	T	6	6	154688	154693	0 %	100 %	0 %	0 %	384133934
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3489	NC_017167	GTGGC	2	10	173144	173153	0 %	20 %	60 %	20 %	384133958
3490	NC_017167	GAA	2	6	173167	173172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133958
3491	NC_017167	CTTCCG	2	12	173217	173228	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384133958
3492	NC_017167	GTGGC	2	10	173355	173364	0 %	20 %	60 %	20 %	384133959
3493	NC_017167	TGA	2	6	173391	173396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133959
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3497	NC_017167	GC	3	6	173619	173624	0 %	0 %	50 %	50 %	384133959
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